ماموریت و اهداف موسسه تحقیقات آب مطابق اساسنامه مصوب، اهداف موسسه تحقیقات آب به صورت زير تعيين شده است: توسعه و گسترش پژوهش، تعميق دانش و توليد فناوری در امور آب كوشش برای دستيابی به دانش و فناوریهای نوين جهاني امور آب كوشش برای دستيابی به دانش و فناوریهای نوين جهانی امور آب وظایف موسسه تحقیقات آب بررسی و شناسايی نيازهای پژوهشی امور آب برگزاری دورهها، همايشها، كارگاههای علمی و تخصصی در زمينهها مرتبط با آب انتشار كتب، نشريات تخصصی و ترويج نتايج تحقيقات ودستاوردهای علمی در زمينه آب تشخيص نيازهای پژوهشی و همكاری در تدوين برنامههای پژوهشی مربوطه ايجاد ارتباط مستمر با دانشگاهها، واحدهای تحقيقاتی و انجمنهای علمی ـ تخصصی موردنياز بخشهای دولتی و غير دولتی در تمامی زمينههای مرتبط با آب ايجاد ارتباط كارآمد با نيازهای متخصص و مبتكر در كشور و فراهم نمودن امكانات لازم برای بهرهگيری از جديدترين دستاوردهای پژوهشی امور آب